En enero de 2021 realizamos el 2º curso de verano de informática genómica titulado «Introducción al Análisis Transcriptómico» en la Universidad de La Frontera (UFRO) como curso de formación para estudiantes e investigadores de biología experimental. Los contenidos del curso cubrieron temas de informática del genoma que van desde cuestiones básicas hasta prácticas. Desarrollamos un programa que combina conferencias, demostraciones, ejercicios y sesiones prácticas, y presentación final para que los participantes puedan adquirir conocimientos y habilidades de manera efectiva.      El profesor Andrés Ávila (UFRO), el Dr. Mikihiko Kawai (Universidad de Kyoto) y Giovanni Larama (UFRO) estuvieron a cargo del programa, y dieron conferencias en corporación con […]

   A principios de enero de 2021, nuestro equipo de SATREPS MACH ha actualizado folletos del proyecto en inglés y disponibles para todo el público.    Folletos de SATREPS MACH en inglés (para público general)

  A principios de diciembre de 2020, nuestro equipo de SATREPS MACH ha preparado folletos del proyecto en inglés y español (dos versiones) disponibles para todo el público Folletos de SATREPS MACH en español (para público general) Folletos de SATREPS MACH en español (para investigadores etc) Folletos de SATREPS MACH en inglés

  Entre el 3 y 6 de noviembre de 2020 como parte del proyecto SATREPS MACH, el Dr. Nagai del Instituto Nacional de Investigación de Ciencias Pesqueras visitó el Laboratorio de Genómica y Ecología Ambiental de la Universidad de Hiroshima.   El propósito de la visita fue detectar rápidamente posibles bacterias alguicidas y utilizar la información para cálculos de regresión asociados con la floración de las algas. Para ello, examinamos muestras de floración mediante amplificación, purificación y la secuenciación del ADN bacteriano en las muestras a través de NGS (secuenciación de última generación) en un plazo menor a 15 horas.   En este experimento, el tiempo requerido para finalizar todo […]

  En Noviembre de 2020, investigadores chilenos y japoneses asociados al proyecto MACH publicaron un artículo científico titulado «Laboratorio de Maleta: Nuevo equipo portátil y desplegable para la rápida detección de determinadas algas nocivas en las aguas costeras chilenas» en la revista científica Environmental Science and Pollution Research.   En este documento se presenta el proceso de muestreo de agua en el campo, la extracción de ADN y la LAMP (Amplificación isotérmica mediada por bucles) para detectar las algas nocivas objetivo (Alexandrium catenella como especie modelo, que es un problema importante en Chile) fueron realizados en 2 horas.      La detección de las especies de algas nocivas mediante un […]

  El 23 de Octubre de 2020, investigadores chilenos y japoneses asociados al proyecto MACH publicaron un protocolo de investigación titulado «16S and 18S Metabarcoding analysis for Chilean coastal waters harmful algal blooms » en el sitio web: protocol.io.   Este protocolo describe la sección de metagenoma de nuestra otra publicación (Int J Environ Res Public Health, 2020, 17(20). doi:10.3390/ijerph17207642) con mucho más detalle para que el funcionamiento de la sección se repita correctamente. El protocolo se estableció en base al análisis de metabarcodificación práctica a través de nuestro actual programa de monitoreo.   Para más detalles, el artículo ha sido publicado en formato “Open-Access” y se encuentra disponible en: […]